汕頭是我國(guó)沿海最早設(shè)關(guān)的口岸之一。早在1685年（清康熙二十四年）粵海關(guān)成立后，即在庵埠設(shè)立庵埠正稅口，后又相繼稱庵埠總口、潮州總口。1853年（清咸豐三年），粵海關(guān)在汕頭媽嶼島設(shè)立海關(guān)，稱潮州新關(guān)，轄原庵埠總口及其所轄各口。1860年（清咸豐十年）1月，被洋稅務(wù)司控制的潮海關(guān)成立，亦稱洋關(guān)，這就是汕頭海關(guān)的前身。1949年10月24日，汕頭解放；25日，軍管會(huì)接管潮海關(guān)。1950年2月，潮海關(guān)更名為中華人民共和國(guó)汕頭海關(guān)，直屬海關(guān)總署。1984年，海關(guān)總署決定，汕頭海關(guān)升格為局級(jí)海關(guān)，直屬海關(guān)總署。

目前，汕頭海關(guān)關(guān)區(qū)范圍包括汕頭（含汕頭經(jīng)濟(jì)特區(qū)）、汕尾、梅州、潮州、揭陽(yáng)等粵東五個(gè)地級(jí)市及所屬30個(gè)縣（市、區(qū)），面積約3.1萬(wàn)平方公里，人口2000多萬(wàn)。陸地海岸線長(zhǎng)330多公里。關(guān)區(qū)內(nèi)有一類口岸5個(gè)（汕頭港、汕尾港、南澳港、潮陽(yáng)港、潮州港），空港2個(gè)，二類海運(yùn)口岸12個(gè)，陸運(yùn)驗(yàn)貨場(chǎng)16個(gè)。